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En Colombia se comercializan biofertilizantes producidos en otros países y también algunos que son resultado de la investigación de grupos colombianos. En la Universidad de La Salle, el grupo de investigación Bioprospección y Conservación Biológica inició en el 2013 un proyecto con el fin de desarrollar biofertilizantes útiles para los suelos de la región del Casanare, que se caracterizan por ser ácidos, con contenidos tóxicos de aluminio y baja concentración de calcio, potasio y fósforo disponible.